荧光定量PCR 技术,是通过在PCR 反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化实时监测PCR 扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,对起始模板进行定量分析的方法,可对初始模版进行绝对定量和相对定量。常用的实验方法有SYBR Green I 法和TaqMan探针法。荧光定量PCR 可用于mRNA 表达量水平检测、MicroRNA 表达量水平检测、RNAi效率检测和基因拷贝数检测。
SYBR Green I 法中,荧光染料SYBR Green I结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的,产生绿色荧光。在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光大大增强。因此,SYBR Green I的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出PCR体系存在的双链DNA数量。SYBR Green I 的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm。
TaqMan探针法中,TaqMan荧光探针是一种由双基团标记的RNA探针,其中荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭基团cu mie则在3’末端。PCR扩增时,加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针。当探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5 -3 外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。常用的荧光基团是FAM,TET,VIC,HEX。
技术流程
1、引物的设计与合成:根据客户的目的基因序列设计特异性的引物(或由客户自行提供),并选择适宜的内参基因及引物;
2、抽提DNA/RNA:抽提RNA定量并逆转录合成cDNA(测DNA拷贝数时直接定量);
3、Q-PCR预实验;
4、定量PCR正式实验;
5、结果及数据分析。
服务内容
•基因组DNA水平基因拷贝数检测
•转录组mRNA水平基因拷贝数检测
•转录组microRNA水平基因拷贝数检测
•RNAi效率检测
客户提供材料
•细胞:细胞数>106;
•组织:总量>100 mg;
•DNA 或RNA 样品:总量>2 μg;
•靶基因信息:包括基因序列或GenBank Accession Number 等;
•背景资料:包括生物物种信息(Human、Mouse、Rat 等)、DNA/RNA 来源、基因丰度等。